组织起草生态保护规划。组织开展生态状况评估、各类创建、复核中的生态环境保护工作，开展生态示范创建。指导协调和监督农村生态环境保护，监督指导并组织实施农业面源污染治理工作。承担自然保护地、生态保护红线相关监管工作。组织开展生物多样性保护。承担生态环境损害赔偿相关工作。监督野生动植物保护和湿地生态环境保护工作。牵头生态环境保护目标责任制考核工作。配合做好中央、省和市生态环境保护督察工作。对上级重大决策、重要文件、重要工作部署贯彻落实情况进行督促检查，负责重要批示督办和群众信访工作。负责地表水生态环境监管工作。组织落实重点流域水功能区划，负责涉水重污染行业整治提升工作。监督管理饮用水水源地生态环境保护工作，监督指导入河（入海）排污口设置。负责海洋生态环境保护工作。承担海洋生态环境调查评价、海洋生态保护与修复监管，监督协调重点海域生态环境综合治理工作。监督陆源污染物排海，负责防治海岸和海洋工程建设项目、废弃物海洋倾倒等对海洋污染损害的生态环境保护工作。